兩限房與經濟適用的區別是:經適房和兩限房的審核標準、房屋購買價格還有日后轉成商品房的出讓手續及費用有區別。審核標準經適房和兩限房都有自己的管理辦法,針對各自的管理辦法,在對審核人的家庭結構、家庭資產、人員工資及審核準入線上,經適房要比兩限房的準入標準高很多,也就是說經適房的準入標準要比兩限房嚴格。購買價格比較好理解,購買經適房或者兩限房,相對來說兩限房要比經適房貴一些,但是從審核標準來講,經適房要嚴一些。日后上市交易,經適房五年后可以上市交易,政府有優先回購權。兩限房五年后上市,除去土地出讓金外,就可以賣出或轉讓房子,且產權也是商品房產權。